More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0212 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  88.13 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  68.38 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  68.01 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  65.44 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  54.78 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  55.05 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  57.25 
 
 		 285 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  57.84 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  55.56 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 		 266 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.77 
 
 		 269 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  56.34 
 
 		 287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  52.22 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  51.6 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.11 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  55.76 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.01 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 266 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  47.57 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.99 
 
 		 270 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  49.44 
 
 		 266 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  53.09 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.26 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  54.01 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.84 
 
 		 268 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.58 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  45.45 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.96 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 264 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.63 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 		 497 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  42.11 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.6 
 
 		 269 aa  205  9e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 270 aa  205  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  52.77 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 		 490 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  53.01 
 
 		 267 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>