More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2435 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  78.8 
 
 		 288 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  76.58 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  67.96 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  67.96 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  64.41 
 
 		 308 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  64.06 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  68.89 
 
 		 299 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  67.28 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  62.31 
 
 		 297 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  64.66 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  55.68 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  57.25 
 
 		 290 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  56.54 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  55.77 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  54.95 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  56.15 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  54.58 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  62.63 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 270 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  58.15 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 262 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  52.38 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.46 
 
 		 490 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 		 270 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 		 272 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.69 
 
 		 497 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 269 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 323 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.33 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 492 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  44.66 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 497 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 		 291 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  49.26 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 265 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 484 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 267 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>