More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1813 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
275 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  63.12 
 
 
271 aa  288  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  56.87 
 
 
271 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  56.49 
 
 
267 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  56.7 
 
 
269 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  51.84 
 
 
259 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
264 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  48.24 
 
 
510 aa  236  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  56.3 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 
288 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 
288 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 
288 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  58.2 
 
 
266 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  58.71 
 
 
269 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  54.07 
 
 
267 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
492 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
270 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
268 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
262 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.42 
 
 
497 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
268 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
260 aa  224  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
266 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
268 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
267 aa  221  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.36 
 
 
280 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.17 
 
 
490 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  49.58 
 
 
494 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
269 aa  218  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
266 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
269 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
271 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
268 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
285 aa  211  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.58 
 
 
264 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
270 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.09 
 
 
260 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
263 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
266 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
266 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
436 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
266 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
275 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  55.86 
 
 
267 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
484 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  52.01 
 
 
303 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
484 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
269 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  52.01 
 
 
303 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  43.22 
 
 
290 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
497 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
264 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
268 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
283 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
272 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  45.93 
 
 
269 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  49.6 
 
 
271 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
284 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
272 aa  203  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
266 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  50.92 
 
 
301 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
270 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
267 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
266 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 
277 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 
265 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
297 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
272 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
270 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.57 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
270 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>