More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1583 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  61.26 
 
 
268 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  63.14 
 
 
273 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  60.32 
 
 
268 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  60.32 
 
 
277 aa  244  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 
264 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
267 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  60.08 
 
 
272 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
497 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  55.77 
 
 
497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
285 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 
272 aa  228  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
484 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
283 aa  224  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  52.73 
 
 
490 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
484 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
267 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
436 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
271 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 
270 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
268 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
264 aa  214  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
268 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  51.46 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.51 
 
 
290 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  45.24 
 
 
260 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  55.73 
 
 
290 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
270 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
270 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
276 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
268 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
267 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
270 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 
265 aa  205  7e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
273 aa  203  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
280 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
267 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
288 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  48.81 
 
 
269 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
270 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
267 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
270 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
267 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  51.37 
 
 
266 aa  201  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.77 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
266 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
260 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
264 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
271 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
269 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  45.38 
 
 
266 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
492 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
494 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
269 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.27 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
479 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
275 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
266 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
266 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
285 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
266 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>