More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0131 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  58.62 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  57.69 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 264 aa  262  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 267 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  48.97 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  49.59 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  51.18 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.79 
 
 		 490 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 436 aa  208  7e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  48.76 
 
 		 484 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 		 268 aa  204  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  48.16 
 
 		 484 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 518 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.96 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  44.08 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  47.62 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  47.62 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  44.19 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 		 285 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  43.61 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  47.23 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>