More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2204 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 294 aa  564  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  74.35 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  65.33 
 
 		 288 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  65.33 
 
 		 288 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  67.69 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  73.72 
 
 		 287 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  66.18 
 
 		 288 aa  329  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  73.61 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  74.72 
 
 		 293 aa  322  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  71.38 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  62.99 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  65.06 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  58.09 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  56.06 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  56.54 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  51.09 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  47.73 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  56.09 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  48.54 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.96 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50.6 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.55 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.82 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.99 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  48.81 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 266 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.98 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  55.93 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 260 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.91 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  55.2 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  49.65 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  42.27 
 
 		 510 aa  205  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 335 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 336 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  49.3 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>