More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0706 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  51.66 
 
 		 436 aa  269  4e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 263 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  55.08 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 267 aa  252  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 		 266 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  47.67 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 490 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 		 497 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 277 aa  221  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 		 297 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  43.66 
 
 		 449 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 274 aa  218  7e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  44.83 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  45.14 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  42.31 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  44.44 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  44.44 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  48.82 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  45.14 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 450 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>