More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4828 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 		 288 aa  291  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  54.18 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  54.18 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  56.18 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  55.88 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  59.25 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  54.07 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  57.04 
 
 		 299 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.68 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.99 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 		 490 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  45.76 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  47.37 
 
 		 531 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 268 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  44.15 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 497 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  49.26 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 484 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  57.72 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.47 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 484 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 286 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  45.35 
 
 		 518 aa  205  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.36 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.52 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 		 497 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  49.26 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>