More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3067 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
299 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  77.94 
 
 
308 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  77.94 
 
 
283 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  65.58 
 
 
288 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  65.58 
 
 
288 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  67.63 
 
 
288 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  68.29 
 
 
297 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  68.89 
 
 
285 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  73.38 
 
 
287 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  72.76 
 
 
293 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  64.31 
 
 
280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  57.04 
 
 
273 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  70.65 
 
 
294 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  54.31 
 
 
285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 
268 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  56.82 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  56.44 
 
 
268 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 
303 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
267 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
266 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 
271 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  56.13 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  53.87 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 
268 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  54.09 
 
 
270 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
271 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
271 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 
293 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 
260 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  53.33 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
267 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
269 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
262 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
264 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
266 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 
266 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
267 aa  222  6e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 
266 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
270 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
264 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.26 
 
 
263 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  46.18 
 
 
269 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
266 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  55.38 
 
 
272 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
335 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
267 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  54.86 
 
 
490 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
267 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
270 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  55.94 
 
 
269 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 
269 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  54.83 
 
 
266 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 
272 aa  215  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  49.47 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.14 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
264 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
336 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
335 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
266 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
267 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
266 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 
436 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
275 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  53.64 
 
 
269 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
269 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 
304 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 
264 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
268 aa  209  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 
269 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 
269 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 
266 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.02 
 
 
266 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
266 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.92 
 
 
265 aa  208  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
266 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
497 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
295 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
264 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>