More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1670 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  62.69 
 
 
267 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  61.48 
 
 
264 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  57.14 
 
 
264 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  57.69 
 
 
267 aa  291  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  55.98 
 
 
262 aa  291  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  56.98 
 
 
264 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  54.62 
 
 
270 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 
260 aa  279  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
272 aa  279  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
263 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 
265 aa  255  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
264 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
283 aa  249  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 
270 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 
270 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 
270 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
285 aa  245  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
260 aa  244  8e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
270 aa  244  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 
268 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  52.55 
 
 
267 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
266 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
266 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
436 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 
267 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  232  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
266 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 
270 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
270 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 
267 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
268 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
290 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 
266 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
268 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
270 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 
267 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.97 
 
 
269 aa  229  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
268 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
264 aa  228  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
288 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
288 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
270 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 
266 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
275 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
278 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  46.04 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  46.04 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  46.04 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  46.04 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
267 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  46.04 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
269 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
268 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
266 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
273 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50.57 
 
 
269 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
269 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
269 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 
264 aa  222  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
274 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
274 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
274 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
272 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  45.66 
 
 
274 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
271 aa  221  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 
285 aa  221  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
269 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>