More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0125 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 285 aa  563  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  63.94 
 
 		 270 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  56.11 
 
 		 268 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  55.34 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 		 266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 		 267 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  48.47 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 266 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  55.68 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  56.44 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  55.85 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  56.06 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  53.53 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  54.34 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  55.09 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  53.96 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  49.26 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  52.79 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  56.23 
 
 		 269 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  54.74 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.9 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.19 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  50.37 
 
 		 531 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  53.16 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  53.16 
 
 		 335 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.41 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.75 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.75 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  50.6 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  47.79 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.66 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  54.31 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  49.28 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 		 778 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  51.64 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  48.54 
 
 		 518 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 		 291 aa  215  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.34 
 
 		 260 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>