More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06838 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  88.07 
 
 		 286 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  73.61 
 
 		 284 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  73.48 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  62.03 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  49.81 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 268 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  51.87 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 266 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  44.61 
 
 		 277 aa  241  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.28 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  47.55 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 267 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 267 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 267 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.18 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 266 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  47.51 
 
 		 269 aa  230  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 267 aa  229  6e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  51.91 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 269 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.23 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  44.24 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 		 490 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  52.83 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  49.27 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  41.75 
 
 		 531 aa  215  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 778 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>