More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2392 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  74.9 
 
 
518 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  100 
 
 
531 aa  1066    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  54.12 
 
 
494 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  53.14 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  42.51 
 
 
518 aa  359  9e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  56.23 
 
 
289 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  52.83 
 
 
266 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 
266 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.04 
 
 
269 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  52.83 
 
 
268 aa  243  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 
268 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  55.96 
 
 
279 aa  236  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
271 aa  233  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1159  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
306 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.79 
 
 
268 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 
285 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  48.85 
 
 
266 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
268 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  50.19 
 
 
599 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
265 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  33.27 
 
 
510 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
267 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
268 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 
267 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.79 
 
 
267 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.79 
 
 
271 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  53.93 
 
 
267 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
267 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.36 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.28 
 
 
270 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  46.91 
 
 
297 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
267 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
264 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
267 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
266 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
267 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 
268 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  42.38 
 
 
267 aa  216  5.9999999999999996e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
269 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  51.5 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
266 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
269 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
269 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  52.4 
 
 
267 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
269 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 
274 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 
269 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 
277 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
270 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.87 
 
 
263 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
323 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
279 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  52.8 
 
 
271 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 
269 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
265 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 
286 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  47.35 
 
 
288 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
271 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 
283 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  41.75 
 
 
295 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
288 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 
288 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
273 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  50.92 
 
 
778 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  51.67 
 
 
269 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  47.81 
 
 
277 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 
284 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
269 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
269 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
264 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
269 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
269 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
269 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  45.38 
 
 
267 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.38 
 
 
267 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
260 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 
295 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  47.21 
 
 
304 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>