More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3577 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  85.77 
 
 		 267 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  85.77 
 
 		 267 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  79.78 
 
 		 267 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  78.57 
 
 		 266 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  79.32 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  78.57 
 
 		 266 aa  427  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  78.95 
 
 		 266 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  79.03 
 
 		 267 aa  424  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  77.44 
 
 		 266 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  78.57 
 
 		 266 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  78.2 
 
 		 266 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  78.2 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  76.69 
 
 		 266 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  76.69 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  76.69 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  76.69 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  75.94 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  60.3 
 
 		 267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  63.88 
 
 		 269 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  62.21 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  63.12 
 
 		 269 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  63.5 
 
 		 269 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  63.5 
 
 		 269 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  63.12 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  58.24 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  59.32 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  59.32 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 		 268 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  61.98 
 
 		 269 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  62.74 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  55.56 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  62.36 
 
 		 778 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.99 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  53.48 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  54.55 
 
 		 274 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  55.04 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  55.34 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 335 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  52.87 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 336 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 335 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  54.78 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  54.2 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 		 284 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  44.98 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  53.88 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 286 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 499 aa  228  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  48.85 
 
 		 531 aa  221  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 497 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  48.09 
 
 		 518 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4939  phosphomethylpyrimidine kinase  57.43 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>