More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2146 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  100 
 
 
518 aa  1040    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  74.9 
 
 
531 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
499 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  54.1 
 
 
494 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
518 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  40.15 
 
 
599 aa  306  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  56.03 
 
 
289 aa  292  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.21 
 
 
266 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  34.77 
 
 
510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 
266 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  55.36 
 
 
279 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1159  phosphomethylpyrimidine kinase  48.74 
 
 
306 aa  237  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.74 
 
 
271 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.52 
 
 
265 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  49.45 
 
 
264 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.2 
 
 
297 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  48.47 
 
 
266 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.22 
 
 
268 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  52.01 
 
 
267 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
267 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.48 
 
 
267 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
268 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
268 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.04 
 
 
271 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 
269 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
266 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
267 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 
269 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  51.69 
 
 
269 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  51.69 
 
 
269 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 
269 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  52.06 
 
 
269 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
266 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 
270 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 
268 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
268 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
266 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
266 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.54 
 
 
285 aa  216  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.54 
 
 
285 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  51.69 
 
 
269 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
266 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
266 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
268 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  54.4 
 
 
267 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.37 
 
 
272 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
266 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
268 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  52.81 
 
 
270 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
323 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 
267 aa  210  5e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
267 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
266 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
266 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
335 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
266 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
267 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
267 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
271 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
335 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 
304 aa  200  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
336 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  47.78 
 
 
274 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 
269 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 
291 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
279 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.59 
 
 
263 aa  196  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
260 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.09 
 
 
284 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 
283 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
265 aa  193  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 
288 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 
288 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 
295 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
778 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
282 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
269 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 
267 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
269 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  51.59 
 
 
271 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
286 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
270 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>