More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10848 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  48.91 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 490 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 497 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 497 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  39.57 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 484 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 285 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 492 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 484 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  40.75 
 
 		 494 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  41.01 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  43.37 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  44.24 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  40.3 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.18 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  42.09 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  38.87 
 
 		 499 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>