More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3294 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  76.81 
 
 
308 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  76.45 
 
 
283 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  71.48 
 
 
297 aa  354  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  75.93 
 
 
287 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  65.34 
 
 
288 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  65.34 
 
 
288 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  65.93 
 
 
288 aa  323  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  70.92 
 
 
299 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  64.66 
 
 
285 aa  295  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  63.81 
 
 
280 aa  292  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2204  phosphomethylpyrimidine kinase  74.72 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.811485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  53.68 
 
 
273 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  57.36 
 
 
271 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
303 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 
303 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
267 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
268 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
268 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
285 aa  235  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
268 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
271 aa  235  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  53.87 
 
 
301 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
262 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  52.09 
 
 
268 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
260 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.71 
 
 
270 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0889  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
293 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000698623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
270 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
269 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0212  phosphomethylpyrimidine kinase  55.76 
 
 
290 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 
270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
268 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  48.89 
 
 
275 aa  218  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  52.21 
 
 
295 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
269 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
264 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.61 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
264 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 
297 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
269 aa  215  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
268 aa  215  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 
268 aa  215  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.61 
 
 
286 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 
304 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
267 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0169  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 
276 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  44.05 
 
 
270 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  51.33 
 
 
291 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
265 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.6 
 
 
272 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
284 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
264 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
323 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  48.37 
 
 
267 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
273 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
264 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.72 
 
 
277 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  45.42 
 
 
269 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  42.29 
 
 
510 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 
281 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  48.76 
 
 
269 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
269 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 
271 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
290 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.93 
 
 
490 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
436 aa  199  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  45.26 
 
 
518 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
266 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  45.87 
 
 
497 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
335 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 
269 aa  199  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 
275 aa  199  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  48.99 
 
 
259 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>