More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1692 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
283 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  61.45 
 
 
263 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  56.52 
 
 
264 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  54.9 
 
 
262 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  54.48 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
267 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  56.2 
 
 
436 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
272 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  56.64 
 
 
264 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 
264 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  56.2 
 
 
267 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
264 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
260 aa  256  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
270 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  56.59 
 
 
264 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  56.3 
 
 
268 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  54.85 
 
 
268 aa  248  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  58.37 
 
 
266 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  56.39 
 
 
266 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34580  phosphomethylpyrimidine kinase  54.06 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
264 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
270 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  59.14 
 
 
267 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
270 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
270 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3441  phosphomethylpyrimidine kinase  54.14 
 
 
268 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.907993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
273 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  52.94 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  48.7 
 
 
270 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 
268 aa  235  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 
261 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
265 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
261 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0424  phosphomethylpyrimidine kinase  52.81 
 
 
276 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  57.25 
 
 
273 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 
264 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 
261 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
266 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  52.17 
 
 
450 aa  228  9e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
266 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  51.98 
 
 
444 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.75 
 
 
490 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 
274 aa  226  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  54.15 
 
 
497 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
280 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
268 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
288 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
288 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 
271 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  51.55 
 
 
288 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  43.82 
 
 
510 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
275 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 
264 aa  219  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3612  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 
277 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  51.38 
 
 
449 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 
271 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8032  phosphomethylpyrimidine kinase  56.3 
 
 
290 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 
270 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 
260 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  45.98 
 
 
271 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8003  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
272 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.17 
 
 
484 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
497 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
268 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
268 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
278 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  43.46 
 
 
274 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  52.96 
 
 
484 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  47.01 
 
 
266 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
285 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 
266 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  43.08 
 
 
274 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>