More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2132 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 282 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  57.75 
 
 		 271 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  59.53 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  57.08 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  55.86 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  56.64 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 		 271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  54.89 
 
 		 490 aa  242  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 		 494 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 492 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 		 484 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  47.22 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.63 
 
 		 484 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 		 497 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 497 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  49.59 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.77 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  48.77 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  48.37 
 
 		 270 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.22 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.02 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.72 
 
 		 436 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.02 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.02 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.02 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.02 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  54.14 
 
 		 478 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  56.93 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.6 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.8 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 		 260 aa  215  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  51.44 
 
 		 266 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  48.66 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 450 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 444 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.59 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 479 aa  211  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.8 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 270 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  49.16 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  43.49 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  43.21 
 
 		 510 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  52.28 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 449 aa  202  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0962  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.547391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.84 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>