More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1225 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  98.52 
 
 
270 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  98.15 
 
 
270 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  72.12 
 
 
270 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  58.66 
 
 
270 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  60.16 
 
 
272 aa  301  9e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  55.25 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
267 aa  245  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
264 aa  242  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
260 aa  241  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
264 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
265 aa  240  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
264 aa  238  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
263 aa  234  8e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
265 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 
260 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  45.06 
 
 
260 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
273 aa  225  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
268 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
266 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 
264 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
264 aa  221  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
497 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  45.88 
 
 
270 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
270 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
269 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 
268 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
266 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
271 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 
264 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
270 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
269 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
268 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
268 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
271 aa  208  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 
285 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
275 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
497 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 
267 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
284 aa  205  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  43.54 
 
 
272 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
274 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
490 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  45.93 
 
 
484 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
288 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
288 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
267 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
288 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  46.88 
 
 
436 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.17 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 
263 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
268 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.72 
 
 
267 aa  198  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 
270 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  38.83 
 
 
510 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
285 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 
285 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  41.48 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
282 aa  195  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  42.26 
 
 
274 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
269 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 
266 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 
277 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  42.26 
 
 
274 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 
269 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 
264 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 
274 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  41.89 
 
 
274 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 
266 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  40.07 
 
 
277 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>