More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0361 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 288 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 		 288 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  38.81 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 436 aa  196  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  39.22 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 		 494 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  40.84 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  40.41 
 
 		 492 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  39.16 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  38.49 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  38.11 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 297 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 		 490 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.4 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  39.71 
 
 		 510 aa  181  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  42.4 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  37.88 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  39.18 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 450 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  37.6 
 
 		 268 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  35.74 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  37.12 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  37.12 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  38.64 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  40.08 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  37.88 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  38.74 
 
 		 444 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  38.24 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>