More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1915 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1915  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
261 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  98.85 
 
 
261 aa  503  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2049  phosphomethylpyrimidine kinase  98.85 
 
 
261 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1765  phosphomethylpyrimidine kinase  83.01 
 
 
260 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.962126  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
264 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
275 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 
283 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
278 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
264 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  54.02 
 
 
274 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
267 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
260 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.48 
 
 
264 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  56.86 
 
 
266 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
262 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  57.59 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
268 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  54.26 
 
 
274 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.315595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
271 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 
285 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  215  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  56.08 
 
 
267 aa  211  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  51.98 
 
 
263 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
266 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 
262 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.03 
 
 
264 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
450 aa  207  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 
270 aa  204  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 
280 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.43 
 
 
267 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  49.79 
 
 
297 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 
264 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  47.24 
 
 
444 aa  202  6e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
490 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
436 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
275 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 
270 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0362  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 
259 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
259 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
268 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
301 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
497 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 
290 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
262 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2379  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
263 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17679 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
449 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
277 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 
273 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 
285 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
288 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 
288 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
259 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
303 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
263 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
270 aa  192  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
269 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
285 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 
303 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
266 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 
265 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 
269 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
269 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
266 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
266 aa  188  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
271 aa  188  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
266 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  46.74 
 
 
266 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
257 aa  187  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
494 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>