More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0990 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  59.7 
 
 		 274 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  59.7 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  59.7 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  59.7 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  59.32 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  59.7 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  59.32 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  59.32 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  58.11 
 
 		 271 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  58.49 
 
 		 273 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  58.94 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  58.94 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  57.74 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  54.92 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 		 273 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  42.45 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  43.65 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.62 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  42.47 
 
 		 264 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.11 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  43.8 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  44.86 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  41.77 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  44.54 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  37.45 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  43.09 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 497 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  42.25 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.19 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 444 aa  172  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.37 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.37 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  39.02 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4277  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.55 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  40.56 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 		 274 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  37.31 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 490 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  39.62 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>