More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1265 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  58.65 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  56.49 
 
 		 275 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  56.6 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  54.47 
 
 		 492 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  56.64 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 		 497 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.7 
 
 		 497 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.89 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  51.56 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 		 484 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 		 484 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.21 
 
 		 510 aa  211  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 269 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  45.74 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 		 268 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  51.05 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.22 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.28 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.44 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.84 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  47.79 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.61 
 
 		 290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  44.72 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>