More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1204 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
269 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  58.8 
 
 
271 aa  288  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  58.71 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  58.58 
 
 
259 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  56.52 
 
 
282 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 
267 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  56.65 
 
 
269 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  57.2 
 
 
271 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
264 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  55.17 
 
 
268 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  51.75 
 
 
288 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  53.15 
 
 
260 aa  231  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
267 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
267 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.4 
 
 
266 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
270 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
288 aa  225  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
288 aa  225  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.15 
 
 
263 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  53.88 
 
 
266 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
266 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.3 
 
 
270 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.46 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.3 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
264 aa  219  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
285 aa  218  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.95 
 
 
490 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
268 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
269 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 
270 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.89 
 
 
273 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 
269 aa  215  5e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
268 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
268 aa  214  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.47 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
494 aa  211  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 
484 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 
262 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
290 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 
484 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 
268 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
263 aa  209  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
280 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
271 aa  208  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
266 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 
264 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 
272 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
269 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
265 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
273 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
492 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
436 aa  205  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  52.12 
 
 
266 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 
479 aa  204  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
497 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
293 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.53 
 
 
510 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
286 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
284 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
274 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 
295 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
277 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  43.5 
 
 
264 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
279 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.98 
 
 
273 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  49.64 
 
 
303 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  49.28 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.24 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
275 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
303 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
276 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
276 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
308 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  51.25 
 
 
272 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
444 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  46.83 
 
 
449 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  52.51 
 
 
267 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
267 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
277 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>