More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0134 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 271 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  59.62 
 
 		 271 aa  298  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  63.12 
 
 		 275 aa  291  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  56.6 
 
 		 267 aa  251  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  53.18 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  53.47 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  57.42 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  54.81 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.74 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  55.85 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 		 492 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.71 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 		 264 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  55.64 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 494 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  54.3 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.17 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  47.66 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.8 
 
 		 510 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  56.25 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.52 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  57.58 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 267 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  48.44 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  42.34 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  48.05 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  56.25 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  52.63 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 295 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.98 
 
 		 497 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  53.47 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 497 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  46.94 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 		 490 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 		 436 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  48.43 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  46.85 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>