More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0368 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  47.01 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  44.02 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  41.76 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  43.6 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  43.9 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  45.59 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  45.75 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.99 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  47.77 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  39.42 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.45 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  46.31 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.73 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 		 492 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  38.01 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  38.99 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  42.01 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.99 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  38.63 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  38.99 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  38.99 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>