More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0143 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.26 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 267 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.91 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  42.42 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.72 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  42.05 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  42.26 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  48.34 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 		 284 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  48.54 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  45.79 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  45.79 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  44.69 
 
 		 269 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  44.49 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  46.4 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  46.44 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.33 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.19 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  43.96 
 
 		 269 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.85 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  45.22 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.1 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  40.81 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.61 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  39.25 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.07 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.64 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  45.24 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.26 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  42.09 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 		 497 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.34 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  42.92 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  43.03 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 490 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  41.46 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  43.5 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  45.09 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  43.91 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  40.89 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  37.82 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  38.89 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 		 270 aa  175  9e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>