More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0957 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 269 aa  540  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  55.02 
 
 		 275 aa  274  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  57.63 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  56.11 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1533  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  47.58 
 
 		 288 aa  214  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  47.58 
 
 		 288 aa  214  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  44.65 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  43.23 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  42.47 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 		 518 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.11 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  43.4 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  46.34 
 
 		 494 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  45.71 
 
 		 492 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.02 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.13 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.96 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  46.96 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  46.96 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.08 
 
 		 490 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  48.86 
 
 		 293 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 		 497 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  44.24 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  44.27 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  45.24 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>