More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4475 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  55.04 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  54.29 
 
 		 269 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  57.08 
 
 		 282 aa  245  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  53.67 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  55.21 
 
 		 271 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.75 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  60.08 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.17 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.16 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  51 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  48.19 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  44.05 
 
 		 260 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  50.21 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.79 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  51.65 
 
 		 479 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  50.21 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  43.14 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.93 
 
 		 490 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  47.7 
 
 		 497 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 492 aa  201  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.47 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 		 484 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 		 484 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.81 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  49.39 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.86 
 
 		 497 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  40.41 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.58 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  48 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 436 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  47.18 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  46.37 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  47.54 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.96 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  50.81 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.16 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  46.22 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.57 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.92 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  49.61 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  42.65 
 
 		 510 aa  191  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  49.39 
 
 		 478 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  37.69 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>