More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2346 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  80.23 
 
 
267 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  64.26 
 
 
270 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  64.12 
 
 
270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
270 aa  325  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
270 aa  325  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
270 aa  325  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 
270 aa  325  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 
270 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 
270 aa  324  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 
270 aa  323  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  59.77 
 
 
263 aa  285  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  59.77 
 
 
264 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
270 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  50.19 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
272 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  49.43 
 
 
274 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  51.88 
 
 
271 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  49.05 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  50.38 
 
 
270 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
267 aa  257  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 
436 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  56.39 
 
 
283 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
267 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  53.64 
 
 
268 aa  254  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  56.7 
 
 
266 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 
285 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  51.76 
 
 
260 aa  245  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 
264 aa  245  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
264 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  51.36 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  53.52 
 
 
266 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  57.09 
 
 
267 aa  242  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
266 aa  241  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  55.91 
 
 
497 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 
450 aa  240  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  54.15 
 
 
490 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
279 aa  238  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
444 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  54.89 
 
 
264 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
269 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  46.46 
 
 
270 aa  237  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  53.94 
 
 
497 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 
275 aa  235  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  45.66 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.76 
 
 
484 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
260 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 
449 aa  230  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 
268 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  50.62 
 
 
484 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  54.58 
 
 
479 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 
264 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
257 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.28 
 
 
268 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 
265 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 
270 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  44.88 
 
 
270 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
278 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
270 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  49.22 
 
 
271 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
284 aa  221  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  50.41 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
449 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 
271 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
288 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
288 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  51.57 
 
 
271 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
264 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2791  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  48.44 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  46.33 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>