More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
218 aa  407  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.62 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42 
 
 
212 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42 
 
 
219 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
211 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.03 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.42 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.19 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0132  thiamine biosynthesis protein ThiC  35.24 
 
 
917 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
213 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.87 
 
 
207 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
409 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.53 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  39.78 
 
 
212 aa  109  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.33 
 
 
208 aa  109  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.07 
 
 
209 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1182  Thiamine-phosphate diphosphorylase  41.11 
 
 
248 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0746327  hitchhiker  0.0037864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.45 
 
 
213 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.65 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.58 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.18 
 
 
211 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.47 
 
 
203 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 
211 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
228 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.33 
 
 
213 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
205 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.52 
 
 
220 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.98 
 
 
206 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
205 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.98 
 
 
360 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
204 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.21 
 
 
211 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.97 
 
 
236 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
214 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
204 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
220 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
352 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.56 
 
 
212 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.16 
 
 
647 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
204 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.49 
 
 
212 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.71 
 
 
204 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
353 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1635  Thiamine-phosphate diphosphorylase  50.31 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0203769  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  33.97 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 
365 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.65 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
220 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
205 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.02 
 
 
350 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.79 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  36.28 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4969  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.43 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  33.64 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
346 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  33.68 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.85 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.62 
 
 
343 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.85 
 
 
356 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.18 
 
 
351 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 
368 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
350 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.66 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.52 
 
 
343 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4940  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.5 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.53 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  35.98 
 
 
478 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.19 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.19 
 
 
226 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.52 
 
 
343 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.19 
 
 
344 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 
227 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.76 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.33 
 
 
343 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.24 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.73 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.2 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
379 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.05 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.08 
 
 
211 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.23 
 
 
218 aa  92  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.27 
 
 
351 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.8 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.24 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  32.02 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.43 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>