More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4341 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  94.63 
 
 
205 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  75.12 
 
 
207 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  75.61 
 
 
207 aa  314  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  74.63 
 
 
207 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  74.63 
 
 
207 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.66 
 
 
207 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.42 
 
 
209 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  68.93 
 
 
209 aa  276  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.56 
 
 
209 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.78 
 
 
209 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54 
 
 
222 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  50.5 
 
 
217 aa  187  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.75 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  48.7 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.23 
 
 
217 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.23 
 
 
217 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.52 
 
 
211 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.15 
 
 
216 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.1 
 
 
209 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.33 
 
 
224 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.14 
 
 
210 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.3 
 
 
208 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.11 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  47.34 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  45.69 
 
 
211 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.81 
 
 
213 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
203 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 
214 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
343 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
343 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.25 
 
 
214 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.46 
 
 
490 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  41.09 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.93 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
497 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 
492 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
379 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
360 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.39 
 
 
346 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
343 aa  118  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
497 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 
353 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.21 
 
 
204 aa  115  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  40.1 
 
 
494 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.83 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.7 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.28 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
209 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  37.17 
 
 
484 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  38.38 
 
 
479 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  37.17 
 
 
484 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.01 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.55 
 
 
347 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 
368 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.35 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
365 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.86 
 
 
207 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
217 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0679  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.55 
 
 
226 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.180423  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.76 
 
 
209 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
206 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 
219 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.33 
 
 
208 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.3 
 
 
214 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.81 
 
 
223 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 
219 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.75 
 
 
211 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
219 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  33.67 
 
 
478 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
255 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
224 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.39 
 
 
343 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0705  thiamine monophosphate synthase  37.7 
 
 
236 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351638  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.66 
 
 
220 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.86 
 
 
221 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.63 
 
 
221 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
216 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  37.77 
 
 
217 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.57 
 
 
352 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
205 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
208 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
219 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
219 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
208 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
344 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>