More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1080 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.9 
 
 
223 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.06 
 
 
219 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.61 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.2 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.95 
 
 
214 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.17 
 
 
216 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.15 
 
 
213 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.97 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
208 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.92 
 
 
204 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  40.3 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.46 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  39.8 
 
 
207 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.08 
 
 
234 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.11 
 
 
217 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  39.38 
 
 
206 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.51 
 
 
207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
207 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.92 
 
 
207 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  39.02 
 
 
209 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
206 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
226 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 
206 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.44 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  43.79 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.91 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
209 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.27 
 
 
205 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.5 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
213 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.28 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  39.81 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
210 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  36.96 
 
 
484 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.8 
 
 
209 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
210 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  34.6 
 
 
210 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.7 
 
 
209 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  36.26 
 
 
212 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.98 
 
 
205 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  33.68 
 
 
497 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
220 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
209 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  35.33 
 
 
484 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.11 
 
 
204 aa  101  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 
214 aa  101  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
217 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
217 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1417  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
208 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  35.35 
 
 
225 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3653  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
198 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.38 
 
 
214 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
207 aa  99  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  37 
 
 
494 aa  99  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0281  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  35.75 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.53 
 
 
343 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.58 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  33.69 
 
 
479 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.38 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
346 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.23 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.71 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2565  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.795825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.61 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  33.54 
 
 
490 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
344 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.5 
 
 
347 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0214  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.2 
 
 
492 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  35.55 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  35.48 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  37 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.6 
 
 
497 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.26 
 
 
209 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
343 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.39 
 
 
223 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.62 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  33.99 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.31 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
343 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.43 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  33.5 
 
 
478 aa  93.2  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.76 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.03 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>