More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1234 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.82 
 
 
203 aa  225  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.23 
 
 
204 aa  214  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.81 
 
 
206 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.31 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.88 
 
 
216 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.84 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.84 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
207 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.36 
 
 
209 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.48 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.61 
 
 
217 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.88 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.88 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  37.87 
 
 
211 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
208 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.96 
 
 
213 aa  124  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
207 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 
492 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  37.7 
 
 
484 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.8 
 
 
210 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.49 
 
 
234 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
479 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 
208 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  30.05 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 
352 aa  112  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.19 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.16 
 
 
343 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.69 
 
 
220 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  33.7 
 
 
497 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  34.34 
 
 
494 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.48 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.62 
 
 
490 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.36 
 
 
343 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.52 
 
 
352 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.04 
 
 
207 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 
352 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
216 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 
343 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
353 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
219 aa  104  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
214 aa  104  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
365 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 
223 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
214 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  36.41 
 
 
211 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.34 
 
 
210 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
218 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.61 
 
 
217 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
219 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.85 
 
 
216 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.73 
 
 
221 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.98 
 
 
220 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.96 
 
 
205 aa  101  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
209 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.79 
 
 
346 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.5 
 
 
205 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
351 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.53 
 
 
216 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.61 
 
 
202 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.79 
 
 
343 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  30.5 
 
 
478 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  33.17 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  32.79 
 
 
213 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0679  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.77 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.180423  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.66 
 
 
350 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.02 
 
 
212 aa  99  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.15 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
347 aa  98.2  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.35 
 
 
351 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.73 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
350 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.5 
 
 
356 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.96 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.53 
 
 
379 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.04 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.44 
 
 
255 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.07 
 
 
220 aa  95.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.34 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.41 
 
 
217 aa  94.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>