More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0392 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
214 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.89 
 
 
211 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  52.22 
 
 
217 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.4 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.32 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.33 
 
 
217 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.33 
 
 
217 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  51.46 
 
 
211 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.46 
 
 
206 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.8 
 
 
210 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.42 
 
 
208 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.33 
 
 
207 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.33 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.83 
 
 
207 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.41 
 
 
204 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.88 
 
 
204 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.85 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.32 
 
 
203 aa  151  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  44.55 
 
 
217 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.15 
 
 
205 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.63 
 
 
224 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.85 
 
 
207 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.96 
 
 
479 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 
497 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.1 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.23 
 
 
490 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.6 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.1 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.2 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.53 
 
 
213 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.58 
 
 
234 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.02 
 
 
222 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  47.29 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
492 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
484 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.93 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 
497 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.24 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.5 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  41.26 
 
 
484 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.37 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.58 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.93 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.65 
 
 
346 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  39.9 
 
 
494 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.38 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.549646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
236 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.93 
 
 
379 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.53 
 
 
206 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
221 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
206 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.57 
 
 
207 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.22 
 
 
536 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.39 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.06 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
204 aa  118  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.06 
 
 
219 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
219 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.41 
 
 
219 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.06 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.7 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.13 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.82 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.35 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.92 
 
 
218 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.67 
 
 
212 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
219 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
343 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
368 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.43 
 
 
343 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
220 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.44 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.33 
 
 
206 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.38 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  40.64 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.8 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.53 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.53 
 
 
210 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 
208 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
347 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.55 
 
 
344 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.93 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  40.86 
 
 
217 aa  111  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.59 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.39 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>