More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5258 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
192 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  49.73 
 
 
202 aa  140  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  47.34 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  45.13 
 
 
205 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  40.91 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  48.69 
 
 
199 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  41.79 
 
 
213 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  44.04 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.27 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.32 
 
 
213 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  37.19 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.69 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  38.89 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.17 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  43.9 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.06 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.83 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  43.72 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  36.87 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.89 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.75 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.23 
 
 
329 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.23 
 
 
329 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.27 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  32.34 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  33.67 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  36.47 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.41 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.56 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  26.52 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.88 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.69 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  30.92 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.92 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  33.17 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.36 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.75 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.27 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.72 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  32.79 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  32.07 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.82 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.7 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.57 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.88 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.03 
 
 
343 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.21 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.36 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.82 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.34 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.11 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.36 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.92 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  37.07 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.11 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.12 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  28.96 
 
 
325 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  30.99 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.64 
 
 
353 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.78 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.94 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.27 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.63 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.69 
 
 
536 aa  62  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.18 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.43 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.17 
 
 
368 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.21 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.63 
 
 
221 aa  61.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.1 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  41.12 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.87 
 
 
350 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  38.55 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  31.22 
 
 
484 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  30.61 
 
 
484 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.83 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.12 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.4 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  28 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.14 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.72 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.77 
 
 
344 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  31.68 
 
 
310 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  32.12 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.72 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>