More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1015 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0487  thiamine monophosphate synthase  43.19 
 
 
212 aa  167  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.43 
 
 
213 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.43 
 
 
213 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1698  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.95 
 
 
213 aa  148  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.27 
 
 
207 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  35.2 
 
 
218 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.61 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
219 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
219 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.1 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
219 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.61 
 
 
223 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.68 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.15 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.36 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.2 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.74 
 
 
209 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.58 
 
 
218 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  35.55 
 
 
478 aa  122  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.8 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 
208 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.98 
 
 
218 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.1 
 
 
206 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
234 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.39 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 
208 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
356 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.22 
 
 
212 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
215 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  35.23 
 
 
211 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
207 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  35.38 
 
 
490 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.08 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 
484 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
205 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.22 
 
 
210 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.12 
 
 
219 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.15 
 
 
219 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  37.38 
 
 
497 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.91 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  38.07 
 
 
497 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
215 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
216 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  35.6 
 
 
484 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  34.34 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.39 
 
 
346 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.09 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.35 
 
 
211 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.22 
 
 
211 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
207 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  36.59 
 
 
494 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
206 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.26 
 
 
216 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.63 
 
 
217 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.63 
 
 
217 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
379 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.92 
 
 
214 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
224 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.39 
 
 
352 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.33 
 
 
216 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.69 
 
 
210 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.35 
 
 
347 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
219 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1224  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.55 
 
 
210 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.71764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.72 
 
 
220 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  31.63 
 
 
492 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.81 
 
 
236 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
228 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
211 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
343 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.87 
 
 
217 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.09 
 
 
217 aa  102  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 
206 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.69 
 
 
208 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.81 
 
 
211 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
211 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.95 
 
 
208 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.69 
 
 
223 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.37 
 
 
205 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
353 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.46 
 
 
223 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
214 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 
343 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1099  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.58 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.238552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  35.67 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.29 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.33 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.28 
 
 
214 aa  99  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>