289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3402 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
197 aa  377  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  45.64 
 
 
192 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  49.44 
 
 
199 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  45.65 
 
 
202 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  42.31 
 
 
232 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  43.35 
 
 
205 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.89 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  39.05 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  55.1 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  38.86 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  37.13 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.34 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  40.3 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.36 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.89 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.41 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.15 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  53.25 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.62 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  32.52 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.09 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.15 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.37 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.65 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  34.38 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  36.21 
 
 
478 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.35 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39 
 
 
346 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
343 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  31.35 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
350 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.96 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
343 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.98 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  36.36 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.73 
 
 
350 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.74 
 
 
365 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.23 
 
 
343 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29 
 
 
351 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.44 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.13 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6577  thiamine monophosphate synthase  32.81 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1955  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.44 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.44 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.24 
 
 
368 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  25.45 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  45 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.35 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  34.38 
 
 
322 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
647 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3431  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.89 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40 
 
 
329 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40 
 
 
329 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  35.15 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  30.88 
 
 
316 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  31.22 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.27 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.96 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4095  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.55 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000665873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  26.52 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 
344 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  25 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2467  thiamine monophosphate synthase  28.57 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571514  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.1 
 
 
209 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.03 
 
 
343 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  33.94 
 
 
315 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  40 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.61 
 
 
217 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0014  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.22 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507656  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.82 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28 
 
 
353 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.64 
 
 
210 aa  54.7  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2894  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.17 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
360 aa  54.7  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.4 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  41.98 
 
 
312 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  40.24 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.88 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.69 
 
 
352 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.28 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.96 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0911  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.302839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.55 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.89 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.94 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.42 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.65 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.85 
 
 
351 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.95 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>