297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0091 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  56.59 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  54.6 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  48.69 
 
 		 192 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  49.21 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  41.08 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  46.52 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  41.67 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  33.71 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.25 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  48.48 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  48.21 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  48.42 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.96 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  48.95 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  41.94 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.53 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  35.2 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.83 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.02 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.88 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.51 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.8 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  34.97 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 		 379 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  34.59 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  33.51 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  37.1 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.65 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.18 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  31.84 
 
 		 310 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.8 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  35.58 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.59 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  35.67 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.43 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.35 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.91 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.29 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  31.68 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  44.44 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.45 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2469  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.02 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.22 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  32.24 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.99 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  31.91 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.82 
 
 		 647 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  39.26 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1852  thiamine monophosphate synthase family protein  21.05 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  31.52 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.31 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.95 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  30.22 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.54 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 		 346 aa  62  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.95 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  22.35 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  39.61 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  30.27 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1187  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  23.59 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.242979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.09 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  32.79 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1064  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  23.59 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.38 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  32.11 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.51 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.34 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.73 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  51.9 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.1 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.79 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  24.47 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.99 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.99 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0738  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.4 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.7 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  31.28 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  28.86 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  28.14 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.95 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  31.37 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>