More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6768 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
214 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  77.45 
 
 
232 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  55.67 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  53.73 
 
 
205 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  48.76 
 
 
202 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  49.07 
 
 
213 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  58.29 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  56.78 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  46.3 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  46.5 
 
 
192 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  50.75 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  41.67 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
218 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  38.57 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.76 
 
 
217 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.8 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
218 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
236 aa  104  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  40.43 
 
 
484 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  38.46 
 
 
206 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
484 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.42 
 
 
222 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.49 
 
 
343 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  33.7 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.38 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.81 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.94 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  42.79 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  38.92 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  32.84 
 
 
490 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.12 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.84 
 
 
353 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.63 
 
 
214 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.03 
 
 
219 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.29 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  43.11 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  42.51 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.33 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.29 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
344 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.84 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.22 
 
 
346 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  35.89 
 
 
497 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.96 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  32.21 
 
 
497 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.88 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
352 aa  89.4  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.77 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  31.35 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  34.07 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.05 
 
 
343 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.55 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.77 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.05 
 
 
343 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.85 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  35.36 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.18 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.62 
 
 
220 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.7 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
216 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.59 
 
 
219 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  35.03 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  34.45 
 
 
494 aa  85.5  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  32.82 
 
 
492 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.58 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  32.86 
 
 
479 aa  85.1  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.96 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.96 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.23 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.96 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.22 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.9 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.41 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  37.21 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.2 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
379 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.9 
 
 
409 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>