More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7515 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
232 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  77.45 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  57.35 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  58.21 
 
 
205 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  58.29 
 
 
205 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  52.04 
 
 
213 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  60.64 
 
 
205 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  44.76 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  43.9 
 
 
192 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  50.25 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.93 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  43.27 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  38.57 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  42.23 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  46.24 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  40.39 
 
 
208 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  45.78 
 
 
203 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
236 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
206 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
222 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 
343 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.48 
 
 
353 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  44.51 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.3 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.11 
 
 
183 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.65 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 
379 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.65 
 
 
178 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.24 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
352 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.55 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  33.01 
 
 
490 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.86 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  37.56 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
343 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
343 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.22 
 
 
346 aa  91.7  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.63 
 
 
217 aa  92  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  35.92 
 
 
202 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
343 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  38.61 
 
 
329 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  38.61 
 
 
329 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  35.29 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.03 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  37.02 
 
 
206 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
346 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
219 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
203 aa  88.6  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.77 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.2 
 
 
409 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.64 
 
 
215 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.61 
 
 
314 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  31.32 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 
204 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 
497 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.73 
 
 
350 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  32.86 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.96 
 
 
365 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.03 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.5 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  34.47 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  34.8 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.71 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.91 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.18 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  40.28 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000497087  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.59 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.23 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  29.44 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1600  thiamine-phosphate diphosphorylase  27.03 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3402  thiamine monophosphate synthase  43.5 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0624  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.62 
 
 
204 aa  82  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 
344 aa  81.6  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.32 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.11 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.89 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  30.81 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.21 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.71 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.16 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  33.52 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.16 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  33.63 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>