More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2226 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
213 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  47.14 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  49.25 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  42.71 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  41.71 
 
 
232 aa  121  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  52.04 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
213 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.33 
 
 
206 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  46.73 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  49.02 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 
220 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  41.79 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.76 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.99 
 
 
209 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.53 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.26 
 
 
215 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.43 
 
 
213 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.04 
 
 
218 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
223 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.15 
 
 
213 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
211 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  48.69 
 
 
205 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
252 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.44 
 
 
213 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.8 
 
 
211 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
223 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.71 
 
 
207 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  40 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
206 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  33 
 
 
490 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.87 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.47 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.21 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
213 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  44.5 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 
353 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
206 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.94 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  34.31 
 
 
492 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
211 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.94 
 
 
178 aa  91.7  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
219 aa  91.3  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.96 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.63 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.98 
 
 
350 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
204 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.65 
 
 
204 aa  89  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  33.01 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.05 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
379 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.08 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.95 
 
 
343 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
484 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
221 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.32 
 
 
210 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  37.16 
 
 
215 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  32.84 
 
 
484 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.95 
 
 
343 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.58 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.71 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.59 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.49 
 
 
365 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  34.18 
 
 
198 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
343 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.22 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  30.15 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.24 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.69 
 
 
352 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  34.95 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.46 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.46 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  33.17 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.84 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0242  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.67 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.784761 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  33.51 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.33 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.57 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.22 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  32.75 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.82 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.7 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  34.18 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6573  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.67 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.775235  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.54 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.35 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>