More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0984 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  44.21 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.68 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  45.55 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  47.15 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  47.15 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.01 
 
 		 314 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.93 
 
 		 310 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  46.11 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  44.68 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  41.21 
 
 		 306 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.03 
 
 		 315 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  39.46 
 
 		 314 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  43.46 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  41.67 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  42.49 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  41.67 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.49 
 
 		 314 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.55 
 
 		 316 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.96 
 
 		 314 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.96 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  46.84 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.25 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  46.84 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.49 
 
 		 315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  46.84 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  38.92 
 
 		 302 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  40.1 
 
 		 317 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  39.89 
 
 		 314 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  38.95 
 
 		 313 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.89 
 
 		 316 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.83 
 
 		 314 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  36.17 
 
 		 325 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  40.31 
 
 		 313 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.79 
 
 		 312 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  35.14 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  37.3 
 
 		 320 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.54 
 
 		 316 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  36.22 
 
 		 320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  37.23 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  36.31 
 
 		 316 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.58 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.75 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 		 352 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.74 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  37.24 
 
 		 319 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 		 218 aa  94.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.12 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.73 
 
 		 352 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  31.09 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.06 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.75 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.09 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.06 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.79 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.12 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.45 
 
 		 351 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.01 
 
 		 343 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.84 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.47 
 
 		 365 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.1 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.48 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 352 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.89 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  36.36 
 
 		 329 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.65 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.72 
 
 		 356 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  42.31 
 
 		 317 aa  85.5  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.32 
 
 		 350 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.48 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.05 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.17 
 
 		 353 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.65 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.1 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.75 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.72 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.75 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.68 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.94 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.93 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.02 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.14 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.04 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.14 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.57 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.85 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.18 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.19 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.71 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.5 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>