More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2440 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  100 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  99.52 
 
 
209 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  100 
 
 
196 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  100 
 
 
196 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  89.29 
 
 
196 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  62.11 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  61.05 
 
 
194 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  63.35 
 
 
194 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  63.16 
 
 
194 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  62.11 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  62.11 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  62.11 
 
 
194 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.02 
 
 
199 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  51.58 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  43.75 
 
 
198 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  45.6 
 
 
302 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  42 
 
 
320 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  41.5 
 
 
320 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  42.79 
 
 
321 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45.5 
 
 
312 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.75 
 
 
310 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  46.77 
 
 
322 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  43.84 
 
 
317 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  41.8 
 
 
306 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.07 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.67 
 
 
314 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  40.62 
 
 
315 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.67 
 
 
318 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.87 
 
 
313 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.58 
 
 
315 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  39.58 
 
 
314 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  39.58 
 
 
314 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  40.3 
 
 
315 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.1 
 
 
316 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  39.06 
 
 
314 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.58 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.58 
 
 
313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.38 
 
 
314 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  39.18 
 
 
316 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  41.24 
 
 
319 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.83 
 
 
316 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  39.78 
 
 
329 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
352 aa  91.3  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.14 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  43.7 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.92 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  37.84 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.97 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.23 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.04 
 
 
353 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.28 
 
 
350 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.12 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.36 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.62 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.66 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.24 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  32.95 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.65 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  36.75 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.89 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4410  thiamine monophosphate synthase  32.83 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.93 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.01 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  35.75 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.32 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.04 
 
 
346 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.17 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  53.16 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.94 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.41 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1099  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.41 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.238552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.33 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.93 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.95 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.15 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1224  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.9 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.71764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.48 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.48 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.88 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.89 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.11 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.59 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.87 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0144  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.36 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.3 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.09 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>