174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2855 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 178 aa  339  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3023  thiamine monophosphate synthase  46.28 
 
 		 208 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0434  thiamine monophosphate synthase  49.11 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61207  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  35.64 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  45.62 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.74 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  36.69 
 
 		 314 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  53.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  53.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  53.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  53.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  53.16 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  53.16 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  53.16 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  32.97 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  51.9 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.89 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  31.52 
 
 		 314 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  47.44 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40.6 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  31.94 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  40.96 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  30.05 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  47.19 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.03 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5033  thiamine monophosphate synthase  33.68 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  46.07 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.41 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  43.56 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  37.58 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  45.45 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  43.56 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  43.56 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  43.56 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.47 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  42.35 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  42.35 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  57.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.81 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  25.5 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  23.08 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.91 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  41.86 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  32.02 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  31.25 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.42 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3633  thiamine monophosphate synthase  32.18 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  29.33 
 
 		 490 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  36.19 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  39.74 
 
 		 320 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  25.63 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  25.28 
 
 		 479 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.14 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  34.03 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  29.79 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  35.24 
 
 		 315 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.27 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  26.26 
 
 		 484 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.03 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  33.67 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  25.14 
 
 		 484 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 320 aa  51.6  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  32.22 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  32.43 
 
 		 325 aa  51.2  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.47 
 
 		 343 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  31.25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  26.78 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  26.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.04 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  30.91 
 
 		 329 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.68 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  35.56 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  29.05 
 
 		 497 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.47 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  27.87 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  25.52 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  30.39 
 
 		 317 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  43.42 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 369 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  35.24 
 
 		 314 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  30.27 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.22 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1852  thiamine monophosphate synthase family protein  21.23 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.71 
 
 		 344 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.52 
 
 		 313 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  32.96 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.8 
 
 		 316 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.84 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.39 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  24.6 
 
 		 492 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.36 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  25.17 
 
 		 497 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.61 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.66 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>