101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2053 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 169 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2855  thiamine monophosphate synthase  44.38 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0770384  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  37.06 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  39.55 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3633  thiamine monophosphate synthase  39.29 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3023  thiamine monophosphate synthase  43.48 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  45.57 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  34.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  53.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  53.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.71 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  53.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  54.84 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.1 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.1 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  53.97 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  52.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  38.75 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.05 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  46.05 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  46.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  34.97 
 
 		 302 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  38.69 
 
 		 315 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  25.81 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000873287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.76 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  42.57 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0348  hypothetical protein  26.9 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.58399  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0434  thiamine monophosphate synthase  54.41 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  42.39 
 
 		 317 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0091  thiamine monophosphate synthase  40.28 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0773  thiamine monophosphate synthase  27.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.158421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  35.77 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.07 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  32.86 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  31.03 
 
 		 325 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.53 
 
 		 315 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4276  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 		 232 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.046902  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  34.21 
 
 		 314 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  34.45 
 
 		 490 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7515  thiamine monophosphate synthase  50.77 
 
 		 232 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 352 aa  47.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.13 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.79 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.65 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 315 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.31 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  33.79 
 
 		 316 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  34.71 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.06 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.31 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.57 
 
 		 318 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  35.04 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.52 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.56 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.34 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  36.84 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.84 
 
 		 314 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.78 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.9 
 
 		 346 aa  44.3  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.08 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.58 
 
 		 217 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.62 
 
 		 343 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.62 
 
 		 343 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  36.08 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6768  thiamine monophosphate synthase  41.51 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  32.54 
 
 		 484 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.76 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.73 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.87 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  38.74 
 
 		 314 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  32.67 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  41.82 
 
 		 322 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.95 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.39 
 
 		 224 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  29.84 
 
 		 484 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.64 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5258  thiamine monophosphate synthase  42.45 
 
 		 192 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.69 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  39.33 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.17 
 
 		 209 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.46 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.52 
 
 		 316 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.39 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.39 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  26.38 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.04 
 
 		 203 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>