151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2070 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  100 
 
 		 152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000873287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  28.38 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  31.82 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  33.33 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  32.61 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  31.88 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  31.88 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  31.88 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  31.88 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  31.88 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  33.33 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  37.1 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  30.2 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  31.82 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0645  transcriptional regulator TenI  32.58 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 		 252 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.99 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  28.69 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.46 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.26 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.2 
 
 		 221 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  27.42 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.23 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.79 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.67 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1146  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/regulatory protein TenI, putative  34.62 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00092958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.34 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.56 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  25.98 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2053  thiamine monophosphate synthase  25.2 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.91 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  28.71 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  27.2 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.03 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.07 
 
 		 343 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  31.5 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.85 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.05 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.83 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  26.56 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.79 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.19 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  35.23 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.45 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.7 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  26.05 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.61 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.63 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.18 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.82 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  25.2 
 
 		 317 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  26.4 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  26.05 
 
 		 316 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.33 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.33 
 
 		 213 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.09 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.28 
 
 		 207 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.67 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  27.05 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.02 
 
 		 352 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  21.71 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  25.58 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  28.7 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.52 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.66 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  26.77 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  27.03 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 497 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  24.62 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  26.85 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  29.7 
 
 		 492 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.62 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.24 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.9 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.02 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.95 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.19 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  22.06 
 
 		 302 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  25.76 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  25.69 
 
 		 325 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.84 
 
 		 344 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  23.85 
 
 		 320 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>