212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1146 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1146  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/regulatory protein TenI, putative  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00092958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1187  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  56.5 
 
 
201 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.242979  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1064  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  56.5 
 
 
201 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0738  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57 
 
 
203 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1745  thiamine monophosphate synthase  30.23 
 
 
211 aa  84.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211367  normal  0.0155398 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1175  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.07 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.18 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1279  thiamine monophosphate synthase  28.27 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.878833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.29 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1869  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.3 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.38 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  23.76 
 
 
314 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0616  transcriptional regulator TenI  31.52 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.07 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.21 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  22.91 
 
 
317 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.93 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507656  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0346  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3854  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  26.4 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0454  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016732 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  25.14 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.92 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  29.55 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.7 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.15 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0547  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.49 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000291317  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  30.68 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  24.19 
 
 
526 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.49 
 
 
344 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1852  thiamine monophosphate synthase family protein  26.67 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0799  transcriptional regulator TenI  28.41 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0695  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0639  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0639  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0806  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.563560000000001e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0729  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.49 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.17 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0144  thiamine-phosphate diphosphorylase  25.15 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0883  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000389091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0786  transcriptional regulator TenI  26.14 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.520662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  23.16 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.86 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  34.62 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000873287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2894  thiamine-phosphate diphosphorylase  21.11 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4545  transcriptional regulator TenI  27.27 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467462  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  22.87 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  20.56 
 
 
302 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  27.08 
 
 
349 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2467  thiamine monophosphate synthase  20.56 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571514  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1955  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.11 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.99 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.53 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3290  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.11 
 
 
307 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  31.21 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.3 
 
 
211 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.7 
 
 
205 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
207 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.11 
 
 
218 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.89 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4095  Thiamine-phosphate diphosphorylase  19.89 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000665873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6225  thiamine phosphate pyrophosphorylase  21.67 
 
 
202 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0618316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0645  transcriptional regulator TenI  25 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  22.78 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1569  thiamine monophosphate synthase family protein  25.69 
 
 
193 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.269331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  21.62 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3431  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  19.57 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.53 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  27.07 
 
 
530 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  18.71 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.67 
 
 
479 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0014  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.55 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  22.09 
 
 
479 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  34.78 
 
 
557 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  20.62 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.86 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.53 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0215  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.63 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.61 
 
 
351 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.05 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  30.38 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  22.99 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  18.05 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  22.47 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  24.03 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.79 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4493  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.79 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0244501 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.86 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.262167 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  20.28 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.09 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  17.53 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.79 
 
 
211 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  hitchhiker  0.0000191197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.03 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.97 
 
 
613 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  19.5 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>