More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1618 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  98.49 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  48.92 
 
 
321 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  43.68 
 
 
198 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.15 
 
 
314 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.32 
 
 
302 aa  148  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  46.03 
 
 
317 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  50.51 
 
 
196 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.96 
 
 
306 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.01 
 
 
318 aa  141  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  51.02 
 
 
209 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  51.02 
 
 
209 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  51.02 
 
 
209 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  51.02 
 
 
209 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  51.02 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  51.02 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  51.02 
 
 
209 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  47.42 
 
 
194 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  47.42 
 
 
194 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  39.89 
 
 
310 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  45.6 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  45.79 
 
 
194 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  39.57 
 
 
320 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.79 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  39.04 
 
 
320 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  44.56 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  44.56 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  44.56 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  37.44 
 
 
316 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  36.41 
 
 
316 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  36.87 
 
 
315 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.65 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  40.12 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.7 
 
 
314 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.74 
 
 
313 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  37.57 
 
 
322 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.65 
 
 
314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.65 
 
 
314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  34.92 
 
 
314 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  36.65 
 
 
313 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  36.26 
 
 
316 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.95 
 
 
316 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  33.33 
 
 
183 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  35.29 
 
 
319 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  33.94 
 
 
325 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  34.38 
 
 
315 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  28.48 
 
 
185 aa  91.7  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.12 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
352 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.93 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.55 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.61 
 
 
220 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.14 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.95 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.95 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  32.47 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.13 
 
 
350 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.31 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.02 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.31 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.74 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.49 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.31 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.31 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.14 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.1 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.59 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.38 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.01 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  39.05 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.18 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.46 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
360 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3653  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.48 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.25 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.12 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.05 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.41 
 
 
536 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.86 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.96 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  32.26 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0773  thiamine monophosphate synthase  27.47 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.158421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  31.61 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.05 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.49 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.25 
 
 
351 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.87 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  26.7 
 
 
479 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.12 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 
343 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.97 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>